Graças à sua altíssima Speed, ao seu Attack sólido e ao seu acesso a uma boa variedade de moves de coverage, Mega Aerodactyl pode ultrapassar e derrotar a maioria do metagame, tornando-o em um bom late-game sweeper. Porém, ele sofre contra equipes mais bulky que possuem Pokémon focados em Defense, como Skarmory e Celesteela. Apesar de a tipagem de Mega Aerodactyl ser imune a golpes Ground-type, sua fraqueza a Stealth Rock não é apreciada, deixando-lhe em uma situação difícil devido à falta de bons removedores de hazard na tier. A tipagem também o deixa vulnerável a moves prioritários comuns, tais como Water Shuriken, Aqua Jet, Bullet Punch e Ice Shard, impedindo que ele realmente exerça sua função como revenge killer, visto que será incapaz de fazer check a Pokémon como Ash-Greninja, Azumarill, Mega Scizor e Weavile. Mega Aerodactyl também leva check de Steel-types comuns, tais como Celesteela, Mega Scizor e Magearna. Ter opções de coverage pode tornar Mega Aerodactyl imprevisível de certa forma, mas também o deixa sofrendo um terrível caso de 4MMS, e ele sempre levará check de uma ameaça mais bulky.
| Move 1: Stone Edge | Item: Aerodactylite |
| Move 2: Aerial Ace | Ability: Pressure |
| Move 3: Ice Fang | Nature: Jolly |
| Move 4: Fire Fang / Earthquake | EVs: 252 Atk / 4 Def / 252 Spe |
Stone Edge é o STAB Rock-type mais forte de Mega Aerodactyl e lhe permite fazer check a ameaças ofensivas, como Mega Charizard X, Mega Charizard Y, Volcarona, Mega Pinsir e Salamence. Aerial Ace é seu move mais repetível, o qual lhe permite fazer check a ameaças mais bulky, como Mega Venusaur, Tangrowth e Mega Heracross. Ice Fang dá a Aerodactyl a capacidade de fazer check a Landorus-T, Garchomp e Gliscor, Pokémon muito fracos a Ice. Mega Aerodactyl geralmente recorre a Fire Fang para dar 2HKO em Steel-types, como Ferrothorn, Mega Scizor, Celesteela e Magearna. Pode-se usar Earthquake no lugar de Fire Fang para fazer check a ameaças ofensivas, como Tapu Koko, Heatran, Magnezone e Nihilego. Roost também é uma opção que concede recovery a Mega Aerodactyl após fazer switch in repetidamente em Stealth Rock. Stealth Rock é um possível move alternativo, visto que Mega Aerodactyl usa Stealth Rock seguramente contra a maioria dos Pokémon, exceto Mega Sableye.
Investimento máximo em Attack aumenta o dano causado por Mega Aerodactyl. 252 EVs em Speed junto a nature Jolly permitem a ele ultrapassar praticamente todo o metagame de OU sem boosts como também Mega Gyarados e Dragonite com +1 em Speed, também permitindo-lhe ter Speed tie com Mega Alakazam e fazendo dele um ótimo revenge killer. Já que as abilities de Pokémon mais rápidos em campo são as primeiras a ativarem, Pressure permite que se possa fazer scout a sets Choice Scarf de usuários de Intimidate, como Landorus-T, e ativadores de Terrain, como Tapu Lele, Tapu Koko e Tapu Bulu. Especificamente, caso as abilities desses Pokémon ativarem antes de Pressure, então o Pokémon em questão é mais rápido do que Mega Aerodactyl.
Mega Aerodactyl geralmente cumpre o papel de late-game sweeper, embora também possa atuar como um bom revenge killer. Ele deve entrar em campo após seus counters terem sido derrotados ou pelo menos criticamente enfraquecidos para que um sweep possa ser feito no late-game. Evite fazer switches ao máximo quando Stealth Rock estiver em campo, já que Mega Aerodactyl muitas vezes não carrega Roost e será facilmente desgastado. Utilize seus moves de coverage para causar dano massivo em switch-ins comuns, tais como Ferrothorn e Landorus-T. Mega Aerodactyl também pode entrar em campo para fazer revenge kill à ameaça oponente após um parceiro ter sido derrotado.
Mega Aerodactyl aprecia a remoção de hazards, fazendo de usuários de Defog, como Tapu Fini e Latios, ótimos parceiros. Tapu Fini e Mega Aerodactyl possuem uma boa sinergia entre si, visto que a primeira faz switch in em fortes Water-types, como Choice Specs Greninja e Ash-Greninja, enquanto Mega Aerodactyl dá check a Pokémon como Mega Charizard Y, Mega Venusaur e Tangrowth. Steel-types, como Ferrothorn e Celesteela, impõem problemas para Mega Aerodactyl, fazendo de Magnezone um parceiro valioso por prender e derrotar os dois anteriormente mencionados. Usuários de entry hazard, como Ferrothorn, Skarmory, Landorus-T e Garchomp, podem apoiá-lo com Stealth Rock e Spikes, que são úteis para enfraquecer a equipe adversária, assim, ajudando no sweep de Mega Aerodactyl no late-game. Protean Greninja é um ótimo parceiro que fornece Spikes, faz check a Garchomp e Landorus-T com Ice Beam e tem boas chances de obter OHKO em Ferrothorn com Hidden Power Fire. Ele ainda pode carregar Extrasensory para derrotar Toxapex, um check a Mega Aerodactyl. O set 3 ataques de Zapdos faz check a Ferrothorn, Tapu Fini e Landorus-T, tornando a ave lendária em outro ótimo parceiro. Bloom Doom Heatran prende e dá OHKO em Water-types, como Tapu Fini, Rotom-W e Slowbro, e realiza check a Steel-types problemáticos, como Mega Scizor.
Começar a partida com Aerodactyl segurando Focus Sash e tendo Taunt e Stealth Rock é um possível set, mas Aerodactyl é superado por Azelf como suicide lead. Pursuit + Roost é outro set comumente utilizado com trappers, como Magnezone, para derrotar cores defensivos. Infelizmente, esse set é superado pelo all-out attacker, já que moves de coverage são vitais para Mega Aerodactyl conseguir danos na maioria da tier. Hone Claws lhe permite causar mais dano, mas não é tão viável, visto que Mega Aerodactyl leva check de usuários de Choice Scarf. No lugar de um move de coverage, Taunt pode prevenir que usuários de entry hazard coloquem Stealth Rock em campo. Thunder Fang é uma opção para acertar Water-types, como Tapu Fini, Greninja e Gyarados, e é levemente mais confiável do que Stone Edge. Defog pode remover hazards, porém, Mega Aerodactyl preferiria ter um move de coverage ao invés dele. Aqua Tail causa mais dano a Hippowdon e, ao mesmo tempo, dá um dano respeitável em Landorus-T.